MolAICal 中文教程

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0. 使用MolAICal进行分子对接

1. 使用MolAICal快速进行从头药物设计

2. 使用MolAICal的深度学习模型和经典算法程序进行GCGR的从头药物设计

3. 使用MolAICal的深度学习模型和分子对接程序进行药物的虚拟筛选

4. 使用MolAICal两步实现对Mpro蛋白活性口袋的虚拟筛选

5. 使用MolAICal基于NAMD模拟结果计算小分子和蛋白MM/GBSA的教程

6. 使用MolAICal计算纳米管和蛋白质孔道半径的教程

7. 使用MolAICal进行药物的QSAR计算

8. 使用MolAICal软件计算Potential of Mean Force(PMF)

9. 使用MolAICal计算配体和受体结合能力的vinardo打分函数

10. 使用MolAICal计算分子合成可行性预测、类药五原则和PAINS的教程

11. 根据常数Kd, Ki, pKd或者pKi使用MolAICal计算结合自由能的操作教程

12. 使用MolAICal进行配体相似性比较或搜索的操作教程

13. 使用PyInstaller打包MolAICal软件深度学习模型“AIGenMols”的例子

14. 使用MolAICal将分子切割成片段

15. 使用MolAICal和OnionNet模型进行药物亲和力的预测

16. 使用MolAICal和Pafnucy模型对药物亲和力进行预测

17. 使用MolAICal进行分子生成和药物改造教程

18. 使用MolAICal对虚拟筛选结果进行聚类

19. 使用MolAICal进行药物ADMET的预测和分子属性的计算

20. 使用MolAICal进行受体和配体批量格式转换和续跑虚拟筛选任务教程

21. 使用MolAICal计算药物化学过滤器MCFs及MCE-18描述符

22. 使用MolAICal进行分子能量最小化的教程

23. 使用MolAICal基于NAMD模拟结果计算小分子和蛋白MM/PBSA的教程

24. 使用MolAICal基于单个PDB文件计算小分子和蛋白MMGBSA和MMPBSA的教程

25. 使用MolAICal和LightDock进行蛋白质-肽分子和蛋白质-蛋白质分子对接教程

26. 使用MolAICal和LightDock进行蛋白质-DNA和蛋白质-RNA分子对接教程

27. 使用MolAICal生成肽的教程

28. 使用MolAICal与LightDock进行多肽虚拟筛选教程-同样适用于蛋白质和核酸的虚拟筛选

29. 使用MolAICal在受体口袋中进行多肽虚拟筛选

30. MolAICal脚本介绍、Linux版MolAICal容器中的程序安装、在Windows和macOS上运行完整版LinuxMolAICal的教程

31. 使用MolAICal发现蛋白受体潜在的活性口袋及位点

 

MolAICal开发版(Development version)教程

注意:本部分教程仅适用于MolAICal的开发版本。如果MolAICal的新版本发布之后,下面的教程将移到上面,请在上面部分找到相关教程。

 

 

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